胸外二科是以胸部肿瘤外科综合诊治为主的外科临床科室，1976年建所初期成立肿瘤外科胸外专业组，此后在张力建教授、杨跃教授等前辈专家带领下发展壮大。目前床位33张，医护人员42人，其中医师18人，护士22人，科研人员2人。医师中正高职6人，副高职5人，主治医师8人，住院医师1人，有18位医师具有博士学位。博导4人，硕导3人，国家级人才1人，北京科技新星3人，北京市科协托举人才2人。科室集医、教、研于一体，以肺、食管恶性肿瘤临床诊治为重点，积极开展对于纵隔肿瘤、胸壁及胸膜肿瘤的临床诊治及科研工作。

擅长较为复杂的大型手术，包括：肺癌手术中气管及支气管袖状成形术、肺血管成形术、隆突肿瘤切除重建术、食管癌根治术及各种消化道重建术、纵隔巨大肿瘤切除及血管移植成形术、心包内全肺切除术、胸壁巨大肿物切除及胸壁重建手术。是国内最早提倡和坚持肺癌规范化手术治疗的中心之一，参与卫生部中国肺癌规范化治疗规范的制定。在国内较早开展胸腔镜肺癌切除、McKeown食管癌切除、Ivor-Lewis食管癌切除、纵隔肿瘤切除等微创手术，技术居国内先进水平，同时开展剑突下纵隔肿瘤切除、纵隔镜食管癌切除等新兴术式。

科室一贯秉承医、教、研协同发展，以科研工作指导临床实践，同时积极践行以手术为主体的肺癌、食管癌个体化综合治疗理念，持续开展围术期新型药物临床研究，为胸部肿瘤患者提供持久生存保障。同时，科室利用人工智能、大语言模型、数字诊疗等前沿技术进行肺癌患者诊疗全流程管理，通过综合性决策支持系统弥补人脑力不足和知识更新过快的诊疗瓶颈问题，在胸部肿瘤新型药物临床研究、胸部肿瘤早诊、临床疗效及预后标志物研发等领域产出多项重要成果。

科室国际学术交流活跃，与多个国际学术组织保持紧密关系，积极参与国际重要学术会议并交流科研成果，接待了多位国际学术组织的领导者和重要学术期刊主编到访。科室积极参加国家援疆、援藏任务，并派出多名骨干人员参与内蒙及云南国家肿瘤区域医疗中心的管理和医疗工作。