胃肠肿瘤转化研究实验室课题组在中国工程院院士季加孚教授带领下，坚持以临床问题为导向的胃癌基础转化研究，依托胃癌临床队列开展胃癌演化进程中多维度时空动态特征解析，新型治疗策略探索及人工智能模型开发等工作。目前共有科研及技术人员11人，其中，正高级职称2人，副高级职称2人，中级职称2人、初级职称4人，在读硕、博士研究生10余人。包括：1.依托高水平的胃癌规范化诊疗临床队列，通过基因组，转录组，蛋白质组等多组学方法筛选胃癌恶性表型及疗效预后密切相关的分子标志物，挖掘有临床应用潜能的治疗靶点。2.单细胞水平时空转录组全面解析胃癌特征性微生态，探索胃癌发生及治疗压力下胃癌各细胞组分及器官之间的动态调控。3.胃癌新型体外模型的构建及抗肿瘤药物筛选平台建立。科室主任季加孚院士主持制定指南及共识23部，包括国内首部胃癌临床实践指南及国家卫健委胃癌诊疗指南等。主编专著 18 部，包括国际首部胃癌英文专著；创办Chin J Cancer Res杂志，被SCI收录；授权专利 20 项，获国家 1 类新药证书 1 项。获光华工程科技奖、何梁何利科学与技术进步奖、国家科技进步二等奖等。实验室与胃肠肿瘤中心临床团队、北大药、基础医、计算机等基础学科交叉融合，协同创新、优势互补，在胃癌微环境解析及调控机制，药敏模型搭建、新治疗靶点开发及人工智能预测模型开发等方面发表了系列合作成果。包括JAMA, Lancet, Science, Cell, Lancet Oncology，Signal Transduction and Targeted Therapy, Molecular Cancer, Gut Microbes, Nucleic Acids Research，Cancer Communications，Advanced Science等。其中高被引论文 9 篇，总被引27066 次。先后承担国家重点研发计划、国家自然科学基金联合基金重点项目、863计划、科技创新2030"四大慢病"重大专项等项目。