结直肠癌中细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)浸润水平较低是免疫疗法的一大挑战。结直肠癌的共识分子亚型(CMS)基于肿瘤属性对患者进行了分类，其中CMS1患者占绝大多数，这类患者表现为高水平的CTL浸润和以及“炎性”肿瘤。表观遗传修饰在基因表达和治疗耐药中起关键作用。在当前研究中，研究者比较了CMS1类患者与其他CMS类患者的DNA甲基化、基因表达和CTL浸润，以确定能够改善CRC中免疫治疗的靶点。(摘要号25)

基于TCGA中RNA测序(511例)以及DNA甲基化(316例)的相关数据探索不同CMS患者基因表达以及甲基化的特征。以CMS1为参考，与其他亚型(CMS2~4)进行比较。基于MCPcounter的方法对肿瘤CTL的浸润水平进行测定。

CMS1和CMS2相比，ARHGAP9、TBX21以及LAG3甲基化水平存在差别，并与CTL评分相关。CMS2中，ARHGAP9和TBX21表达降低，且呈现低甲基化。CMS1和CMS3相比，CMS3中ARHGAP9、TBX21、FMNL1、HLA-DPB1、STX11表达水平均下调，且与CTL评分高度相关。CMS3中ARHGAP9、FMNL1、HLA-DPB1和STX11的甲基化程度较低，TBX21在两组中均存在甲基化但在CMS1中甲基化水平较高。CMS1和CMS4相比，CMS4患者中TBX21是唯一出现下调、低甲基化的基因，且与CTL评分高度相关。

研究者将CMS1与其他CMS组进行比较，发现有6个基因存在表达以及甲基化的差别，且与CTL浸润水平呈现高度相关。与CMS1相比，TBX21是CMS2-4中唯一一个存在基因表达以及甲基化差别，且与CTL评分高度相关的基因。T-bet可能是CRC中T细胞反应的关键调控因子。 (编译 赵英颖)