德国马尔堡大学Denkert等报告的一项研究结果表明，可以通过突变特征的组成来预测肿瘤的临床行为，特别是对新辅助化疗的疗效和耐药性肿瘤的无病生存，以此作为肿瘤个体基因组史的指标。在进行其他验证后，或可使用突变特征来鉴定对新辅助化疗反应率提高的肿瘤，并为以后的治疗干预确定治疗耐药的亚组。(Ann Oncol. 2021年1月6日在线版 DOI：10.1016/j.annonc.2020.12.016)

在异常的DNA编辑、诱变剂或年龄相关DNA改变等因素(以发生每个肿瘤的特定突变状态)的驱动下，内源性和外源性突变不同的过程可发挥超出恶性肿瘤进化史的作用。这些突变过程的特征可以在大型基因组数据集内找到。

该研究探讨了这样的假说，即突变特征的基因组模式与乳腺癌的临床行为有关，特别是化疗的反应和生存，尤其是对治疗耐药性的疾病。

前瞻性新辅助多中心GeparSepto研究的405个治疗前样本，接受了全外显子测序，以分析11种突变特征，包括APOBEC诱变、同源重组缺陷(HRD)、错配修复缺陷，以及年龄相关或烟草相关变异等生物学过程。

乳腺癌的不同亚组，主要由HRD相关和APOBEC相关突变的特征，以及激素受体(HR)阴性和HR阳性肿瘤之间的显著差别和年龄、Ki-67、免疫学参数的相关性来定义。可以确定病理完全缓解率升高与新辅助化疗相关的突变过程，且极具意义。

在HR阳性肿瘤特征的单变量分析中，S3(HRD，P<0.001)和S13(APOBEC，P=0.001)以及外显子突变率(EMR，P=0.002)与pCR率增加显著相关。S3(HRD，P=0.006)和S4(烟草，P=0.011)的特征预示着化疗耐药患者的DFS缩短。

(编译 胡杨)